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      機(jī)器學(xué)習(xí)方法在亞細(xì)胞定位中的應(yīng)用研究.doc

      資料分類:理工論文 上傳會員:翩翩起舞 更新時間:2022-05-12
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      摘要:蛋白質(zhì)是基因功能的主要執(zhí)行者,每種亞細(xì)胞為蛋白質(zhì)行使特定功能提供場所,蛋白質(zhì)只有在相應(yīng)的亞細(xì)胞中才能正確的發(fā)揮作用,生命活動才得以順利的進(jìn)行。否則,機(jī)體功能紊亂,甚至威脅到生命健康。因此,研究蛋白質(zhì)功能的基礎(chǔ)是對蛋白質(zhì)的亞細(xì)胞定位的研究,同時對于研究某些疾病發(fā)病機(jī)理和研制針對疾病的新藥物以及探索生命規(guī)律和奧秘有重大意義。

      本文采用ZD98,CL317和ZW225共三組亞細(xì)胞數(shù)據(jù)集檢驗方法的有效性。我們將特異性打分矩陣提取的信息與偽氨基酸方法結(jié)合,即提取了氨基酸的進(jìn)化信息,也反映了氨基酸的順序信息。通過主成分分析方法將所提取的特征信息降維,去除冗余信息。最后,通過支持向量機(jī)分類算法,通過杰克刀檢驗分別計算出三組數(shù)據(jù)的精確度,特異度及相關(guān)系數(shù)來反映我們所提方法的有效性。

       

      關(guān)鍵詞:特異性打分矩陣;亞細(xì)胞定位;機(jī)器學(xué)習(xí)方法;主成分分析

       

      目錄

      摘要

      Abstract

      1 緒論- 1 -

      1.1 研究背景及意義- 1 -

      1.2 國內(nèi)外研究概況- 1 -

      1.3蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位概述- 2 -

      1.4章節(jié)安排- 2 -

      2 蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位研究- 3 -

      2.1數(shù)據(jù)集- 3 -

      2.2研究步驟- 4 -

      2.2.1 信息提取與選擇- 4 -

      2.2.2分類算法- 6 -

      2.3已有結(jié)果介紹- 7 -

      3 一種新的蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位信息提取方法研究- 9 -

      3.1材料和方法- 9 -

      3.1.1特征提取- 9 -

      3.1.2 特異性打分矩陣(PSSM)- 10 -

      3.1.3特征表示- 10 -

      3.2特征選擇- 11 -

      3.3結(jié)果分析- 12 -

      3.4結(jié)論- 13 -

      致    謝- 15 -

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      上傳會員 翩翩起舞 對本文的描述:蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位是指在蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能未知的前提條件下,預(yù)測出其處在細(xì)胞中哪個指定區(qū)域或細(xì)胞器。蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位知識有如下三點(diǎn)意義:(1)亞細(xì)位的知識能夠為蛋白質(zhì)......
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