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摘要:蛋白質(zhì)是基因功能的主要執(zhí)行者,每種亞細(xì)胞為蛋白質(zhì)行使特定功能提供場所,蛋白質(zhì)只有在相應(yīng)的亞細(xì)胞中才能正確的發(fā)揮作用,生命活動才得以順利的進(jìn)行。否則,機(jī)體功能紊亂,甚至威脅到生命健康。因此,研究蛋白質(zhì)功能的基礎(chǔ)是對蛋白質(zhì)的亞細(xì)胞定位的研究,同時對于研究某些疾病發(fā)病機(jī)理和研制針對疾病的新藥物以及探索生命規(guī)律和奧秘有重大意義。 本文采用ZD98,CL317和ZW225共三組亞細(xì)胞數(shù)據(jù)集檢驗方法的有效性。我們將特異性打分矩陣提取的信息與偽氨基酸方法結(jié)合,即提取了氨基酸的進(jìn)化信息,也反映了氨基酸的順序信息。通過主成分分析方法將所提取的特征信息降維,去除冗余信息。最后,通過支持向量機(jī)分類算法,通過杰克刀檢驗分別計算出三組數(shù)據(jù)的精確度,特異度及相關(guān)系數(shù)來反映我們所提方法的有效性。
關(guān)鍵詞:特異性打分矩陣;亞細(xì)胞定位;機(jī)器學(xué)習(xí)方法;主成分分析
目錄 摘要 Abstract 1 緒論- 1 - 1.1 研究背景及意義- 1 - 1.2 國內(nèi)外研究概況- 1 - 1.3蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位概述- 2 - 1.4章節(jié)安排- 2 - 2 蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位研究- 3 - 2.1數(shù)據(jù)集- 3 - 2.2研究步驟- 4 - 2.2.1 信息提取與選擇- 4 - 2.2.2分類算法- 6 - 2.3已有結(jié)果介紹- 7 - 3 一種新的蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位信息提取方法研究- 9 - 3.1材料和方法- 9 - 3.1.1特征提取- 9 - 3.1.2 特異性打分矩陣(PSSM)- 10 - 3.1.3特征表示- 10 - 3.2特征選擇- 11 - 3.3結(jié)果分析- 12 - 3.4結(jié)論- 13 - 致 謝- 15 - |